微生物16S rRNA测序+代谢组学研究:标题:EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠粪便、脑组织*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育障碍,目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明,肠道菌群与ASD发展之间存在联系,但肠道菌群与ASD的脑功能障碍(肠脑轴)联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因(位于7q号染色体,属于受体酪氨酸激酶Eph家族),因基因突变和在ASD患者中表达下调,被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关,并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺,调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层(mPFC)(关键的肠脑功能轴)的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。欧易生物助力靶向/非靶向代谢组学研究。上海中山大学代谢组学平台
作者研究发现**酸过量会导致葡萄酒颜色变浅,但**酸干扰对酵母细胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均无***影响,随后通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸干扰过程中葡萄酒代谢物的变化,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,通过加速其异构化来削弱花青素浓度,从而影响葡萄酒色泽,因而在葡萄酒生产中过程中应避免**酸过量。通过非靶代谢组学技术,能够了解发酵过程中,发酵液代谢物的变化情况。了解到在糖酵解过程中,多余的PA会扰乱糖酵解和三羧酸循环的过程,从而深入了解葡萄酒发酵过程中颜色变化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年来,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。目前鹿明生物在顶空代谢组学研究已经有了成熟的技术方法和多项项目经验。江苏代谢组学教材代谢组学组学领域新方法和思路。
粪便LC-MS代谢组学研究方法,2022年,复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法,发现了DADS***减轻了DSS诱导下肠道白色念珠菌***,并改变了小鼠肠道微生物群落结构和代谢特征,探究了DADS可以调节肠道微生物群和代谢物并保护肠道屏障的内在机理,为***白色念珠菌***提供了理论依据。
LC-MS非靶向代谢组学研究方法,2021年11月,宁波大学海洋科学学院王春琳团队在Frontiers in Marine Science期刊发表了题为“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,发现了氨基酸和能量代谢是参与青蟹适应盐度变化的主要因素,而脂质代谢物起辅助作用。中文标题:青蟹在适应盐度急剧下降过程中的代谢变化研究对象:青蟹发表期刊:FrontiersinMarineScience影响因子:4.912发表时间:2021年11月2日合作单位:宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室运用生物技术:LC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)代谢组学四大公司 代谢组学一般研究方法及步骤代谢组学分析流程。
代谢组学+转录组学,中文标题:基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象:斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588运用生物技术:代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。研究认为获得的数据可以为不同类型杀菌剂及其混合物对水生生物的毒性提供理论依据。代谢组学大起底—探究小分子物质研究。江苏巨噬细胞代谢组学
氨基酸代谢组学,胆汁酸代谢,脂肪酸代谢,神经递质代谢,花生四烯酸代谢。上海中山大学代谢组学平台
通过转录组学和代谢组学(GC-MS非靶向代谢组学)对BPF暴露和对照组的细胞进行分析,筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析,找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析,揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式,发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变,揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR上海中山大学代谢组学平台
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